光谱法结合分子对接研究普罗帕酮与牛血清白蛋白的相互作用

李楠，曾观娣，孙正华，银兴峰

广东省高等学校功能蛋白研究重点实验室教育部肿瘤分子生物学重点实验室暨南大学生命与健康工程研究院

摘 要：综合运用圆二色谱、停留-动力学、荧光、同步荧光、三维荧光、等温量热滴定法（ITC）等技术并结合分子对接进行表征牛血清白蛋白（BSA）与普罗帕酮的结合热力学及结合动力学参数。研究结果表明,BSA对普罗帕酮结合特异,在291K,298K,310K二者的亲和常数分别是2.612×105,2.879×105,6.793×105mol-1,结合位点数n约为1。同步荧光光谱及三维荧光光谱表明,普罗帕酮与BSA结合后,荧光光谱发生蓝移,揭示BSA结合药物分子后高级构象发生变化。BSA结合普罗帕酮的停留-动力学反应符合三级指数方程曲线,快反应在约0.03 s完成结合,结合速率常数k1=0.097!0.02 s-1,k2=1.058!0.18 s-1,k3=31.410!1.18 s-1。进一步通过分子对接显示普罗帕酮结合在蛋白的I域的IB疏水性口袋中,有12个氨基酸残基参与配体结合,其中Tyr160与Phe13各提供1个氢键参与配体结合,而带电氨基酸Glu125,Lys136,Arg185紧紧把配体束缚在结合口袋中。研究工作将有助于在分子水平上更为详细了解普罗帕酮与BSA的相互作用,并为进一步了解普罗帕酮在生物体内的作用提供理论基础。

关键词：普罗帕酮;圆二色谱;荧光光谱;停留-动力学;分子对接;