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基于光谱法和计算模拟研究PFBSK与HSA的相互作用

来源期刊:桂林理工大学学报2019年第2期

论文作者:魏雨晨 易忠胜 徐婕 赵赛 王海洋

文章页码:474 - 481

关键词:全氟丁基磺酸钾;人血清白蛋白;分子对接;分子动力学模拟;荧光光谱法;

摘    要:采用分子对接、动力学模拟和荧光光谱法研究全氟丁基磺酸钾(PFBSK)和人血清白蛋白(HSA)的相互作用机制。分子对接分析表明,PFBSK在HSA的位点Ⅱ处以氢键作用力稳定结合。动力学模拟的结果表明,PFBSK与HSA相互作用产生的复合物具有良好的稳定性,并使HSA的构象发生改变。结合自由能贡献分析表明,ARG348、ARG484、ARG485、ALA449为PFBSK与HSA结合的关键氨基酸残基。荧光光谱试验显示PFBSK和HSA的结合淬灭了HSA的内源性荧光,淬灭机制为静态淬灭。根据热力学参数吉布斯自由能(ΔG<0)、焓变(ΔH<0)和熵变(ΔS<0),可推断PFBSK和HSA的相互作用力主要是氢键和范德华力,这与分子对接和结合自由能分析结论一致。

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基于光谱法和计算模拟研究PFBSK与HSA的相互作用

魏雨晨,易忠胜,徐婕,赵赛,王海洋

桂林理工大学化学与生物工程学院

摘 要:采用分子对接、动力学模拟和荧光光谱法研究全氟丁基磺酸钾(PFBSK)和人血清白蛋白(HSA)的相互作用机制。分子对接分析表明,PFBSK在HSA的位点Ⅱ处以氢键作用力稳定结合。动力学模拟的结果表明,PFBSK与HSA相互作用产生的复合物具有良好的稳定性,并使HSA的构象发生改变。结合自由能贡献分析表明,ARG348、ARG484、ARG485、ALA449为PFBSK与HSA结合的关键氨基酸残基。荧光光谱试验显示PFBSK和HSA的结合淬灭了HSA的内源性荧光,淬灭机制为静态淬灭。根据热力学参数吉布斯自由能(ΔG<0)、焓变(ΔH<0)和熵变(ΔS<0),可推断PFBSK和HSA的相互作用力主要是氢键和范德华力,这与分子对接和结合自由能分析结论一致。

关键词:全氟丁基磺酸钾;人血清白蛋白;分子对接;分子动力学模拟;荧光光谱法;

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