基于ELM的蛋白质二级结构预测及其后处理
来源期刊:东北大学学报(自然科学版)2009年第10期
论文作者:赵相国 王国仁
文章页码:1402 - 1405
关键词:蛋白质二级结构预测;ELM;基于概率的合并算法;Helix-后处理算法;
摘 要:将ELM应用到蛋白质二级结构模型的训练中,在此基础上提出了基于概率的合并算法(probability-based combining,PBC),用该算法预测结果的合并.根据生物学中关于蛋白质二级结构的特征提出了预测结果的Helix-后处理(Helix-post-processing,HPP)算法,对合并后的预测结果进行有效的后处理,从而进一步提高预测结果的准确率.分别在CB513和RS126两个数据集上进行了实验,实验结果表明,预测结果的准确率是令人满意的,尤其是实现了训练时间上的显著缩短.
赵相国,王国仁
东北大学信息科学与工程学院
摘 要:将ELM应用到蛋白质二级结构模型的训练中,在此基础上提出了基于概率的合并算法(probability-based combining,PBC),用该算法预测结果的合并.根据生物学中关于蛋白质二级结构的特征提出了预测结果的Helix-后处理(Helix-post-processing,HPP)算法,对合并后的预测结果进行有效的后处理,从而进一步提高预测结果的准确率.分别在CB513和RS126两个数据集上进行了实验,实验结果表明,预测结果的准确率是令人满意的,尤其是实现了训练时间上的显著缩短.
关键词:蛋白质二级结构预测;ELM;基于概率的合并算法;Helix-后处理算法;