一种序列家族Profile HMM寻优的PSO
来源期刊:昆明理工大学学报(自然科学版)2007年第1期
论文作者:陈雄峰
文章页码:50 - 53
关键词:Profile HMM;PSO;HMM模型;
摘 要:针对在训练一个序列家族的Profile HMM时经常会得到局部最优HMM的问题,也就是说找到全局最优Profile HMM的概率不高.通过分析训练一个序列家族Profile HMM方法的特点和Profile HMM本身的结构特点提出了一种结合多个局部最优或次优Profile HMM来寻找最优模型的PSO算法,以提高序列家族Profile HMM寻优的概率.
陈雄峰
闽江学院计算机科学系 福建福州350108
摘 要:针对在训练一个序列家族的Profile HMM时经常会得到局部最优HMM的问题,也就是说找到全局最优Profile HMM的概率不高.通过分析训练一个序列家族Profile HMM方法的特点和Profile HMM本身的结构特点提出了一种结合多个局部最优或次优Profile HMM来寻找最优模型的PSO算法,以提高序列家族Profile HMM寻优的概率.
关键词:Profile HMM;PSO;HMM模型;