基于微流控芯片的流式线虫机器学习图像识别系统
来源期刊:功能材料与器件学报2019年第4期
论文作者:杨光 何玲宇 高林耿 何希文 李栋基 韩超 王疏影 吴佳颖 陈翔
文章页码:286 - 292
关键词:微流控芯片;秀丽隐杆线虫;计算机视觉;自动化平台;
摘 要:秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans,以下简称线虫)作为一种体内模式生物被广泛应用于药物筛选、神经生物学等研究中。生理指标(体长等)是线虫研究的重要部分,利用图像识别进行线虫形态特征研究相比传统方法具有精度高的优点。近年来微流控芯片由于其特征尺度与线虫大小尺度匹配、易于自动化等优点,被越来越多地应用在细胞与微米尺度生物的研究中。文章介绍了一种基于微流控芯片的流式线虫图像识别系统,该系统利用设计的微流控芯片,实现单线虫快速流过检测通道,通过搭建的基于机器学习的机器视觉模块,在流动过程中对线虫形态特征进行快速分类,分类结果可作为后续分选操作的依据。
杨光1,何玲宇1,高林耿1,何希文1,李栋基1,韩超1,王疏影1,吴佳颖2,陈翔1
1. 上海交通大学微纳电子学系2. 上海交通大学医学院
摘 要:秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans,以下简称线虫)作为一种体内模式生物被广泛应用于药物筛选、神经生物学等研究中。生理指标(体长等)是线虫研究的重要部分,利用图像识别进行线虫形态特征研究相比传统方法具有精度高的优点。近年来微流控芯片由于其特征尺度与线虫大小尺度匹配、易于自动化等优点,被越来越多地应用在细胞与微米尺度生物的研究中。文章介绍了一种基于微流控芯片的流式线虫图像识别系统,该系统利用设计的微流控芯片,实现单线虫快速流过检测通道,通过搭建的基于机器学习的机器视觉模块,在流动过程中对线虫形态特征进行快速分类,分类结果可作为后续分选操作的依据。
关键词:微流控芯片;秀丽隐杆线虫;计算机视觉;自动化平台;